バルク（細胞の塊）RNA-Seqは、サンプル集団の平均的な遺伝子発現を測定します。
- 低発現の遺伝子を検出可能
- 細胞種の共通の特徴の解析に有効
- 新規及び既知の転写物、融合遺伝子、アリル特異的発現を同定することが可能
- 生物由来の細胞や組織からTotalRNAを抽出する。
- PolyA構造をキャプチャしてmRNAからcDNAを合成する。
- cDNAを断片化し、シーケンスアダプターを付加し、ライブラリーを調製する。
- NGSによるトランスクリプトームの塩基配列情報を読み取る。
- データをマッピングし、発現遺伝子を定量する。
受託可能なサンプル
* 微量サンプルの場合はお問い合わせください。
RNAサンプルは、バイオアナライザ或はTapeStationと分光光度計等により、品質（QC;Quality Control）チェックや濃度測定を行います。
高品質なサンプルを調製するため、ご送付いただく組織・細胞等は、できるだけ新鮮なものをご用意ください。
解析例
定量解析結果 (納品物に含まれます)の例を示します。
料金・納期
細胞種や解析内容によっては、上下することもございます。
| 受託内容 | シークエンサー（データ量） | 金額（税別） | おおよその納期 | |
|---|---|---|---|---|
| 国内完結プラン | 通常 | NovaSeq（3000万ペアリード） | 1サンプル：￥38,000 | 6週間 |
| 微量 | 1サンプル：￥38,000 | |||
| 海外格安プラン | 通常 | DNBSeq（2000万ペアリード） | 1サンプル：￥27,500 | |
| NovaSeq（2000万ペアリード） | 1サンプル：￥30,000 | |||
| オプション | 金額（税別） |
|---|---|
| RNA抽出（RNeasy Mini Kitの場合） | 1サンプル：￥6,000 |
| その他 | ご相談ください |
※4サンプルからの受注となります。
サンプルの送付方法
核酸・セルペレットの場合は1.5ｍLのヒンジ付きマイクロチューブ（核酸の吸着が少ないもの）に入れ、油性マジックを用いて、チューブ側面にサンプル名または番号を記入してください。（シールを使用する場合、-80℃以下での使用が可能なサンプルシールを使用し、フタの部分のみに貼り付けてください。シールがはがれるとサンプルの判別が困難になりますので、シールを張る場合も、油性マジックを用いて、チューブ側面にサンプル名または番号を記入してください。）
フリーザーボックス等チューブを保護できるものにいれ、発泡スチロール等に十分な量のドライアイスを同梱したうえ、冷凍便にて弊社へ平日(10:00〜17:00)に到着するよう配達日時をご指定の上お送りください。
よくあるご質問
受付できるミニマムサンプル数はいくつですか？
最小4サンプルからの受付となります。
納品までどのぐらい時間がかかりますか？
サンプル受領後おおよそ6週間かかります。
提供予定のサンプルが規定量より少ない場合は、受け入れ可能ですか？
はい。微量サンプルの場合も受け入れ可能です。 お問い合わせください。
データはどのように保管されますか？
解析データやお客様のサンプル情報等は納品後、3ヵ月まで当社内で保管しています。3ヵ月を経過すると廃棄しますので、予めご了承ください。