シングルセル遺伝子発現、シングルセル免疫プロファイリングの詳細情報
サンプル受け入れ条件
凍結細胞からの調製の場合、以下の条件を満たすサンプルのみ受け入れ可能です。
- 細胞が単離された状態で凍結されている
- 細胞数100万細胞以上
- (凍結融解後)生存率80%以上
- 細胞サイズは直径30μm以下
- (ヒト生体試料・臨床検体の場合)情報が匿名化されている
受入れ条件を満たさない場合もご相談ください
- 凍結すると生存率が下がる
- 細胞数が少ない
部分的な委託について
組み合わせ方を自由に、必要な工程だけをご依頼いただくことも可能です。
「サンプル調製からライブラリ作製まで」「cDNA合成後から」「シーケンスのみ」など、工程の一部のみの受託も承っております。
オプションについて
出張実験対応:出張で新鮮細胞から対応できます
細胞数が少ない場合や凍結すると生存率が低くなる場合、Chromium X/iX を研究室に持ち込み、新鮮細胞からシングルセル化を行います(別途オプション価格+交通費実費がかかります)。
サンプル混合(hashtag抗体:オプション)
- 複数サンプルを混ぜて解析することが可能です。
- 下のマーカーが発現している細胞であれば、DNAバーコードのついたHashtag抗体(BioLegend社 Totalseq-BまたはC抗体)を結合させ、解析時にサンプルごとに分離できます。
- ヒト:CD298 または β2ミクログロブリン
- マウス:CD45 または H-2 MHCクラスI
- 複数サンプルを混合すると、1サンプル当たりの解析コストは抑えられます。ただし、1サンプル当たりの解析細胞数はその分減少します。
- BioLegend社のライセンスの都合上 、Totalseq抗体はお客様でご購入する必要があります。
CITE-seq (表面タンパク質検出:オプション)
- シングルセルレベルで細胞表面タンパク質の検出を行うことができます。
- 興味ある細胞表面タンパク質が発現している細胞に、抗原特異的な抗体(BioLegend社Totalseq-BまたはC抗体)を反応させ抗体由来ライブラリを作製し、表面タンパク質の発現を解析できます。
- Loupe BrowserでTotalseq抗体とmRNA由来の発現パターンの比較が可能です。
- BioLegend社の試薬をお客様にご購入いただき、弊社に送付いただく必要があります。