Visium 空間的遺伝子発現の詳細情報

サンプル受け入れ条件

• HE染色・イメージングし、崩れがないことを確認している
• 切片のサイズはキャプチャーエリア（6.5mm x 6.5mm）以内に収まること
  薄切片を10 µm以下で切り出せること
• 包埋方法はOCTのみ。 規定品を使用していること
  Tissue-Tek* O.C.T. Compound 25608-930（サクラファインテック）
  既定の方法で凍結し、組織切片を作製・切り出していること
• （弊社へ委託可能）GEXの解析を行うサンプルは、TOによる細胞透過酵素の反応時間を検討済みである
• サンプル中のRNAの品質が高いこと
  （弊社へ委託可能）事前に、OCT包埋組織から薄片を切り出しRNA抽出を行い、RIN値が７以上であることを確認していること
• 外部リンク：Visium Spatial Protocols – Tissue Preparation Guide

事前提出いただくデータ

ご委託時に以下のデータを確認させていただきます。
いずれも弊社に委託可能です

• HE染色画像：ダメージの少ない組織切片であることを確認します。
• 新鮮凍結サンプルの場合：組織のRIN値：7以上あることを確認します。

参考画像

サンプル送付の注意事項

サンプル送付の際には以下の点を確認の上お送りください。

• 送付時期について事前に弊社へお知らせください（実験スケジュールを調整し、切片作成からできるだけ速やかに実験を実施します）。
• TOを併せて弊社に委託する場合は先にTOのみをお送りください。
• サンプルを搭載したスライドガラスは50mL遠沈管等の密閉容器に入れて送付してください。
• 遠沈管には乾燥剤（シリカゲル）をサンプルに直接当たらないように入れてください。
• 発泡スチロール容器にドライアイスと同梱のうえ冷凍便にてお送りください。

サンプル調製のフロー

10x Genomic社のVisium Spatial Kitを使用し以下のフローでサンプルを調製します。